SCIGRESS--分子动力学及多功能分子设计模拟软件包

         SCIGRESS 先进的分子建模和可视化功能使得研究者可以方便的导入多种实验方法所得的分子结构,也可以轻松的建立一个新的结构。除了丰富的建模工具外, SCIGRESS也提供了强大的计算引擎和全面的分析工具。

         分子动力学计算引擎Materials Explorer是由日本FUJITSU公司开发的一种高效的商业化的多用途分子动力学软件包。Materials Explorer功能非常强大,有63个力场供选择,可以用来研究有机物、高聚物、生物大分子、金属、陶瓷材料、半导体等晶体、非晶体、溶液、流体、液体 和气体的相变、膨胀、压缩系数、抗张强度、粘度、热导率、缺陷等。小分子药物与生物大分子的对接以及小分子药物的构效关系一直是计算机辅助药物设计中两项 非常重要的内容。Scigress继承了CAChe的功能,提供了这两项计算功能。此外,Scigress还包括了使用广泛的半经验量化计算模块。通过 Scigress,研究者可以完成扫描分子势能面,确定化学反应机理,寻找反应过渡态,分析红外紫外光谱,明确分子轨道中的电子跃迁,常规分子动力学模 拟,计算众多材料体系的力学与热力学性质,模拟晶体的外延生长与表面吸附的动态行为,预测小分子在多孔材料中的分布情况,列举分子的低能构象,建立药物分 子的构效关系模型,完成小分子药物与生物靶标的对接等多种科研任务。 

         SCIGRESS 实现了Client-Server 构架。研究者可以简便的利用位于Microsoft Windows 平台下的界面进行建模和结果分析,把大量的计算任务分配到服务器或计算集群中进行。这样就使得研究者可以对更大的体系进行更精确的模拟计算。

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