[lammps教程]OVITO绘制原子运动轨迹线

一区Script Materialia期刊：多主元素合金中的短程有序域扩散一文，研究了CrCoNi合金和MoNbTa合金中原子的扩散过程，文中有出现如下图所示的原子运动轨迹线。这种原子运动轨迹线我们在研究扩散过程中常常会用到。

图参考自：Bin Xing, Xinyi Wang, William J. Short-range order localizing diffusion in multi-principal element alloys，Scripta Materialia, 2022

本文将介绍如何利用OVITO软件再现文章的不同颜色的原子的轨迹图

1、打开OVITO界面并且导入数据文件

2、选择该原子模型的某一面，我选择的视角为(left)

3、开始将该原子面开始删除为只包含一层原子的模型，先采用Expression selection，并且在Boolean expression中选择Position.X <=1

4、采用Invert selection 进行反向选择

5、采用Delete selected 将反选择好的原子删除掉，得到了只有一层原子面

6、选择Manual selection中的Pick对该原子表面的其中一个原子进行标定

7，选择Generate trajectory lines,选择加载的原子轨迹为5000帧，加载完之后在Tracjectory display中修改轨迹的颜色以及线宽，如下

得到该选定原子的5000帧之前的全部原子轨迹

8,若想得到其他原子不同颜色的轨迹，重复上述操作7，本次操作只选择5种不同颜色的原子轨迹图

由于所选择的原子并非在原子表面移动，所以，根据实际情况而定，这样就初步得到3个不同颜色的原子轨迹

9、将这一层原子的颜色调整成一种颜色，（根据个人喜好来），然后调整原子的半径大小

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