请教竖向地震动反应谱分析

我没有做过竖向地震动反应谱分析，只做过一般的动力分析 (瞬态、谐波、随机和谱分析)，试试解答你的问题：
1、竖向地震反应谱和水平地震反应谱施加方法基本一样，但是载荷方向不同。
2、如何考虑竖向自重的影响？
好像一般地震谱给出的是加速度，可以试试将整个加速度谱都叠加上一个重力加速度 (加还是减，需要考虑加速度的方向)，作为一个新的谱，施加到结构上
3、我加竖向地震动反应谱计算得到的结构内力比自重作用下静力计算的内力还小，很明显不对，怎么会出现这种情况呢?
不了解你的具体情况，很难分析。不过，你的地震谱没有考虑自重影响应该是因素之一。
4、如果完全按照水平加速度反应谱的加载方式，那么输出的结果就只是动力的，是没有考虑竖向自重的？
确实如此，除非你的地震谱中包含了重力。